Δεν συμφωνεί το Οικουμενικό Πατριαρχείο Κωνσταντινουπόλεως με τις συνταγματικές αναθεωρήσεις που σχετίζονται με την Εκκλησία κι εντάσσονται στις προτάσεις Τσίπρα. Το Φανάρι επίσης αντιτίθεται και στην συμφωνία του πρωθυπουργού με τον Αρχιεπίσκοπο Αθηνών και πάσης Ελλάδας Ιερώνυμο, αναφορικά με την αποσύνδεση των κληρικών από τη μισθοδοσία του κράτους.
Αναλυτικότερα σε σχέση με την αναθεώρηση του άρθρου 21 για τον θεσμό της οικογένειας, εκφράζεται η αντίθεση του Οικουμενικού Πατριαρχείου για την απάλειψη της φράσης ότι η «οικογένεια αποτελεί θεμέλιο της συντήρησης και της προαγωγής του έθνους», με την επισήμανση ότι ο ευλογημένος θεσμός της οικογένειας αποτελεί βασικό κύτταρο του Γένους και χρίζει ρητής συνταγματικής προστασίας και όχι υποβάθμισης.
Όπως αναφέρεται παράλληλα στην ανακοίνωση του Πατριαρχείου, η ενίσχυση του θεσμού της οικογένειας καθίσταται αναγκαία λόγω τόσο της υπογεννητικότητας, όσο όμως και των ποικίλων αναγκών που έχουν οι πολύτεκνες οικογένειες.
Επιπλέον για το άρθρο 3 του Συντάγματος μέσω του οποίου εισάγεται διάταξη ότι η ελληνική Πολιτεία είναι «θρησκευτικά ουδέτερη» το Οικουμενικό πατριαρχείο εκφράζει τον έντονο προβληματισμό του για τις παραγόμενες νομικές συνέπειες που μπορεί να υπάρξουν στην Ορθόδοξη Εκκλησία ανά την ελληνική επικράτεια.
Όπως σημειώνεται στη σχετική ανακοίνωση, επιχειρείται μέσω αυτής της ρύθμισης η αποδυνάμωση της θεσμικής θέσης του Οικουμενικού Πατριαρχείου ως Νομικού Προσώπου Διεθνούς Δημόσιου Δικαίου, η κατάργηση των θρησκευτικών γιορτών, η αποβολή της Εκκλησίας από τον δημόσιο βίο, ενώ θα δημιουργήσει ερείσματα για τη μεταβολή όλων των υφιστάμενων νομικών πλαισίων ανά την Ελλάδα.
Αναφερόμενο στο ζήτημα μεταβολή του υφιστάμενου εργασιακού καθεστώτος, το Φανάρι υποστηρίζει ότι είναι αναγκαίο να παραμείνουν οι κληρικοί στο καθεστώς της Ενιαίας Αρχής πληρωμών, αφού η οποιαδήποτε αλλαγή, στην ουσία θα επιφέρει μεταβολή προς το χειρότερο των υφιστάμενων εργασιακών σχέσεων.
Το Πατριαρχείο καταλήγει πως επιζητά την καλή συνεργασία με την ελληνική Πολιτεία και τον ελληνικό Κλήρο, διευκρινίζοντας ωστόσο πως έχει ιερό χρέος ως προς την προάσπιση των παραδόσεων του ελληνικού λαού.