Τις ημερομηνίες αλλά και τον τρόπο διεξαγωγής όλων των φάσεων του Κυπέλλου Ελλάδας, γνωστοποίησε η ΕΠΟ, επισημοποιώντας την κατάργηση των Ομίλων.
Η κλήρωση της 1ης φάσης, όπου θα λάβουν μέρος οι Κυπελλούχοι των Ενώσεων, θα διεξαχθεί στις 9 Αυγούστου.
Στην 3η φάση θα μπουν στη διοργάνωση οι ομάδες της FootballLeagueκαι στην 4η αυτές της Σούπερ Λιγκ 2. Οι ομάδες της Σούπερ Λιγκ 1 θα ξεκινήσουν σταδιακά να μπαίνουν στη διοργάνωση, από την 5η φάση.
Αναλυτικά το σύστημα διεξαγωγής του Κυπέλλου Ελλάδας:
1η φάση: 25/8/2019: Συμμετέχουν οι Κυπελλούχοι των ΕΠΣ
2η φάση: 1/09/2019: Συμμετέχουν οι νικήτριες ομάδες της 1ης φάσης
3η φάση: 14-15/9/2019: Συμμετέχουν οι νικήτριες ομάδες της 2ης φάσης και οι ομάδες της FL
4η φάση: 24-25-26/9/2019: Συμμετέχουν οι νικήτριες ομάδες της 3ης φάσης και οι ομάδες της SL2
5η φάση: 1η αγωνιστική: 29-30-31/10/2019 2η αγωνιστική: 3-4-5/12/2019: Συμμετέχουν οι νικήτριες ομάδες της 4ης φάσης, οι 8 ομάδες της SLαπό την 6η έως την 13η θέση του βαθμολογικού πίνακα περιόδου 2018-19 και η πρωταθλήτρια ομάδα της FLπεριόδου 2018-2019.
6η φάση: 1η αγωνιστική: 7-8-9/1/2020, 2η αγωνιστική: 14-15-16/1/2020. Συμμετέχουν οι νικήτριες ομάδες της 5ης φάσης και οι 5 ομάδες της SLαπό την 1η έως την 5η θέση του βαθμολογικού πίνακα περιόδου 2018-19.
7η φάση (Προημιτελική): 1η αγωνιστική: 4-5-6/2/2020. 2η αγωνιστική: 11-12-13/2/2020. Συμμετέχουν οι νικήτριες ομάδες της 6ης φάσης
8η φάση (Ημιτελική): 1η αγωνιστική: 04-05/03/2020, 2η αγωνιστική: 22-23/04/2020 Συμμετέχουν οι νικήτριες ομάδες της 7ης φάσης
Τελικός: Σάββατο, 23/5/2020 .