Το πρωτάθλημα της Γ’ Εθνικής Κατηγορίας καθιερώθηκε από την ΕΠΟ την ποδοσφαιρική περίοδο 1982-83, αν και η ύπαρξή της ανεπίσημα χρονολογείται από την περίοδο 1965- 66 και επίσημα ως Γ’ Εθνική για μία μόνο χρονιά, το 1966-67.
Το 1982-83 καθιερώθηκε επίσημα η Γ’ Εθνική κατηγορία, αρχικά σε έναν πειραματικό όμιλο των 16 ομάδων, ενώ από την επόμενη χρονιά οι όμιλοι έγιναν δύο (Νότιος και Βόρειος). Από την περίοδο 2010-11 ως την περίοδο 2012-13 η Γ’ Εθνική μετονομάστηκε σε Φούτμπολ Λιγκ 2, με διοργανώτρια Αρχή του πρωταθλήματος την Ένωση Επαγγελματικού Ποδοσφαίρου Β’ και Γ’ Εθνικής Κατηγορίας (Football League), υπεύθυνη και για τη διεξαγωγή του πρωταθλήματος της Β’ Εθνικής κατηγορίας.
Από την περίοδο 2013-14 η Φούτμπολ Λιγκ 2 και η Δ’ Εθνική καταργήθηκαν και επανήλθε η Γ’ Εθνική ως εθνική ερασιτεχνική κατηγορία σε ομίλους, με την ΕΠΟ να επανέρχεται ως διοργανώτρια αρχή του πρωταθλήματος.